Ochorenie
Všeobecne možno povedať, že kliešťová encefalitída prebieha horšie u dospelých ako u detí a že po stretnutí s vírusom získava človek s normálne pracujúcim imunitným systémom imunitu proti typu vírusu, ktorý ho napadol, a prípadne aj proti príbuzným vírusom. Táto imunita však nie je trvalá, postupom času slabne.
Choroba (ak vôbec prepukne) môže mať podobu len ľahkých bolestí hlavy a zvýšenej teploty alebo (v druhej fáze) ťažký priebeh spojený s prudkými bolesťami hlavy, vysokými horúčkami, dezorientáciou, poruchami motorickej koordinácie atď. Pri ťažkom priebehu môže dôjsť k úmrtiu alebo k dlhodobejším či doživotným následkom v podobe ochrnutia, poruchám sústredenia či zníženiu intelektuálneho výkonu.